Навля была оккупирована в начале октября 1941-го года. Под немецким «новым порядком» поселок жил без малого два года. Все это время мощное сопротивление врагу оказывали партизанские отряды, самый известный из которых - «Смерть немецким оккупантам!».

Партизаны регулярно нападали на немецкий гарнизон, организовывали засады, устраивали диверсии, взрывая мосты и пуская под откос эшелоны. Порой им даже удавалось на время изгонять оккупантов из некоторых населенных пунктов Навлинского района.

Партизанские отряды сыграли важнейшую роль и в освобождении поселка. Еще до прихода частей Брянского фронта, в июле-августе 1943 года навлинские партизаны уничтожили 1442 немецких солдат и офицеров, 86 платформ с военной техникой, 183 платформы с боеприпасами, 6137 метров железнодорожного полотна и 11 километров телефонно-телеграфной линии связи. Были совершены налеты на гарнизоны противника в нескольких населенных пунктах: Алешенка, Журавка, Прилепы, Синезерки, Чичково, а также в Бражино, Гощь, Верхополье, Сергеево Карачевского района, Лопушь и Кресты Выгоничского района, Рябчевск и Яковлевка Трубчевского района.

В августе 1943 года Орловский штаб партизанского движения разработал план взаимодействия партизан с частями Центрального и Брянского фронтов по освобождению территории области. Так, партизаны бригады «Смерть немецким оккупантам!» обеспечивали проход частей Красной Армии в лесном массиве между Навлей и Суземкой, уничтожая противника.

В западной части Навлинского района партизаны закрепились и не пропускали врага вплоть до 8 сентября, когда к ним подошли части 84-й гвардейской Карачевской стрелковой дивизии. В районе деревень Сытенки и Думча партизаны соединились с действующими частями Красной Армии и оказывали им посильную помощь в освобождении района.

7 сентября в результате проведения войсками Брянского фронта под командованием генерала армии Маркиана Попова наступательной операции Навля была освобождена. В боях за поселок принимали участие части 10-й гвардейской отдельной танковой бригады, 5-й, 11-й, 84-й гвардейских, 169-й стрелковых дивизий, входивших в состав 11-й гвардейской армии под командованием генерал-полковника Ивана Баграмяна. 

Навля по праву носит звание «Поселок партизанской славы». В годы Великой Отечественной войны звания Герой Советского союза были удостоены командир объединенных партизанских отрядов Южного лесного массива Дмитрий Емлютин и знаменитый подрывник, автор мины «НН» Александр Ижукин, а также посмертно создатель отряда «Летучка №1» Филипп Стрелец.